Approfondir notre compréhension du cerveau humain au cours du développement
Le programme Brain Functional Genom Program (BFGP) vise à répondre aux questions clés suivantes :
- Quelles sont les signatures moléculaires des cellules cérébrales humaines à travers l'âge, dans la santé et la maladie ?
- Quelles sont les fonctions des gènes clés dans le développement, la fonction et la maladie du cerveau ?
Les objectifs du projet
L'objectif principal du programme est d'approfondir notre compréhension du cerveau humain au cours du développement en reliant les lieux d'expression des gènes à leurs fonctions, en fournissant à la vaste communauté qui se concentre sur les maladies neurologiques et neurodégénératives des techniques établies et robustes et des outils caractérisés.
Objectif 1 : Atlas de la signature moléculaire du cerveau humain et de la souris au cours du développement.
Nous tirerons parti de notre expertise dans les technologies de pointe pour réaliser la visualisation 3D (iDISCO) des transcriptions, combinée à la transcriptomique spatiale sur le cerveau fœtal humain et le cerveau de la souris au cours du développement. Nous développerons des stratégies pour l'imagerie de grands échantillons, dans le but non seulement de développer un atlas du cerveau humain, mais aussi de fournir à la communauté un pipeline complet, du protocole à l'analyse.
Objectif 2 : Criblage fonctionnel des variantes génétiques à l'origine de maladies dans la neurogenèse.
L'objectif est de construire une bibliothèque IPSC de clones caractérisés. Nous construirons une bibliothèque d'ARN guides pour l'ensemble du génome par silencieux génique (interférence CRISPR). Cette bibliothèque servira à générer des lignées de cellules IPS individuelles qui seront criblées en 2D. Des modèles plus complexes, tels que les organoïdes, seront utilisés dans une phase ultérieure du programme.
Objectif 3 : Quantification des types de cellules assistée par l'apprentissage automatique.
Établir des connexions entre les ensembles de données (objectifs 1 et 2) à l'aide de l'apprentissage automatique.
